史料彙編
臺灣社會生活文書專輯（臺灣史料叢刊5）
口述歷史
蘭大弼醫生口述歷史（口述歷史專刊2）
史料彙編
Formosa and its Inhabitants=福爾摩莎及其住民（臺灣史料叢刊4）
史料彙編
福爾摩莎考察報告=Rapport sur Formose（臺灣史料叢刊3）
論文集
平埔族群與臺灣歷史文化論文集
史料彙編
臺灣總督田健治郎日記（上）、（中）、（下）（臺灣史料叢刊2）
論文集
契約文書與社會生活（1600-1900）
論文集
威權體制的變遷：解嚴後的臺灣
史料彙編
灌園先生日記（一）～（二十七）（臺灣史料叢刊1）
論文集
五十年來臺灣方志成果評估與未來發展學術研討會論文集
論文集
臺灣商業傳統論文集
工具書
One Thousand Westerners in Taiwan, to 1945;A Biographical and Bibliographical Dictionary
史料彙編
Aborigines of South Taiwan in the 1880s
論文集
臺灣史研究一百年：回顧與研究
口述歷史
走過兩個時代的人——臺籍日本兵（口述歷史專刊1）
專刊
台灣歷史圖說
史料彙編
清末臺灣海關歷年資料=Maritime Customs Annual Returns and Reports of Taiwan 1867-1895（Ⅰ）、（Ⅱ）
口述歷史
臺籍日本兵座談會記錄并相關資料
論文集
平埔研究論文集
史料彙編
臺灣平埔族文獻資料選集——竹塹社（上）、（下）（中央研究院臺灣史田野研究室史料叢刊系列之一）