日治初期總督府曾設立掌管衛生之部門，但屬軍政時期的臨時機關，1896年4月實施民政，總督府總務部設置衛生課，地方官廳警察課則設衛生係，是殖民地衛生行政體制的初步建立。總督府衛生課掌理的事務包含傳染病、地方病等醫療事務、海港檢疫、衛生工事，以及鴉片取締等；地方的衛生行政則交由警察負責，在執行傳染病防治時可增強其管制性。1898年後藤新平提出「臺灣統治救急案」，認為殖民地行政改革應著重恢復臺灣舊有自治行政，並以警察組織居監督之責。在歷經多次官制改革後，1902年起，總督府以警察本署臨時防疫課（鼠疫防治單位，1909年廢除）、衛生課為中心，聯繫地方警務課衛生係，具備近代衛生專業的警吏作為領導、監督的角色，配合保甲組織深入殖民地社會基層，強制管理各家戶的衛生事務。

圖7：保正甲長職務圖

保正與甲長的職務主要是「上意下達，下情上達」，保甲規約明載其主要任務為戶口調查、監視出入者、警戒風水災害、傳染病預防、戒除鴉片吸食、預防蟲害獸疫、勞動服務等。附屬於警察系統的保甲制度，是使衛生行政得以貫徹至社會基層的關鍵。保甲制度源於清代民間自治自衛的鄉莊組織。1898年8月，日人為了鎮壓臺人武裝抗日，強化保甲制度、公布保甲條例，以十戶為甲，設甲長；十甲為保，設保正；保甲民有連坐之責，需警戒水火災、防禦「土匪」。（圖7，《臺北州警察衛生展覽會寫真帖》，影像號：T0156P0011-0035-000）

           圖8：1910年吉岡喜三郎日記               1920年臺東廳警部吉岡喜三郎津貼給與狀

1910年9月1日，臺南廳警務課警部補吉岡喜三郎（1882-1967，日本千葉縣人）為成為警界幹部，進入臺灣總督府警察官及司獄官練習所，展開10個月的練習生生活。日記中記錄每日所上課程，除了民、刑事法之外，還需學習能和臺灣民眾溝通之「土語」（臺灣語）、法醫學與衛生。1919年8月至1920年9月，吉岡兼任臺東廳警務課衛生係長。由於正值流感、霍亂流行之際，因其協助霍亂流行預防救治，於1920年3月獲發津貼。（圖8，〈吉岡喜三郎文書〉，影像號：T0747_01_0001-0082、T0747_01_0001-0083、T0747_02_0038-0001）